Metoda postępowania przy zmianach opisywanych jako CIN3 zależna jest przede wszystkim od wieku pacjentki i planów, co do ewentualnej ciąży w przyszłości. U pacjentek w wieku pomenopauzalnym i okołomenopauzalnym oraz takich, które nie planują ciąży w przyszłości usuwa się narząd rodny. Natomiast w innych przypadkach wykorzystuje się elektrokoagulację, krioterapię, laseroterapię, wycięcie pętlą elektryczną, elektrokonizację lub konizację chirurgiczną.